Το έργο περιλαμβάνει παρεμβάσεις ενεργειακής αναβάθμισης των κτηρίων, με εφαρμογή μέτρων εξοικονόμησης ενέργειας, εγκατάσταση σύγχρονων συστημάτων θέρμανσης και ψύξης, αξιοποίηση ανανεώσιμων πηγών ενέργειας και ανάπτυξη συστημάτων παρακολούθησης και διαχείρισης ενέργειας. Παράλληλα, δημιουργείται το «Ενεργειακό Μονοπάτι», μια εκπαιδευτική διαδρομή που προάγει την ενημέρωση και ευαισθητοποίηση των επισκεπτών σε θέματα ενέργειας και βιώσιμης ανάπτυξης.

Επιπλέον, προβλέπεται η αναβάθμιση του εκθεσιακού χώρου μέσω της εφαρμογής της μουσειολογικής και μουσειογραφικής μελέτης, με εμπλουτισμό των εκθέσεων με νέα εκθέματα, ψηφιακά μέσα και διαδραστικές εφαρμογές, με στόχο την ανάδειξη της φυσικής ιστορίας, της βιοποικιλότητας και της αλληλεπίδρασης ανθρώπου και περιβάλλοντος. Το έργο συμπληρώνεται από υπηρεσίες συντονισμού, επίβλεψης και τεχνικής υποστήριξης για την αποτελεσματική υλοποίηση των παρεμβάσεων.

Στόχος του έργου είναι η ανάδειξη του Μουσείου Φυσικής Ιστορίας Κρήτης σε ένα σύγχρονο κέντρο επιστήμης, εκπαίδευσης και πολιτισμού διεθνούς εμβέλειας.